生物工程实验教学中心，主要由工业微生物实验室、发酵工程实验室、基因工程实验室、细胞工程实验室和生物工程实训中心组成。其中，工业微生物实验室和生物工程实训中心面向食品学院的四个专业（食品科学与工程、食品安全、生物工程、应用化学），发酵工程实验室、基因工程实验室、细胞工程实验室是生物工程专业的专业实验室。

生物工程实验教学中心成员有12人，其中专职人员3人，兼职实验教学人员9人。实验队伍中高级职称人员9人，占75%，中级职称人员3人，占25%，有博士学位教师占75%。2010年统计开设的实验课程数为9门，实验项目66个，实验学生人数380人/年，年实验人时数约22800。生物工程实验教学中心可使用的实验室面积2500m²，教学仪器与科研仪器总资产约1200万元。

近年来，得到学校和上级部门的大力支持和扶植，2000年投资200万元为生物工程专业配置了5升搅拌式通风发酵罐、蛋白质纯化仪、30升—300升搅拌式发酵罐放大集成实验控制系统，初步建立了发酵工程实验室；2003年学校投资120万元配置了PCR仪、双向电泳仪、高速低温离心机、凝焦成像仪、超低温冰箱等仪器，组建了分子生物学实验室；2008年获得校级“发酵工程及工业分析实验平台”建设经费150万；2009年获得省财政“生物工程产品创制实验室”建设经费80万。2010年11月获得浙江省实验教学示范中心建设点。

1．工业微生物实验室：工业微生物实验室自从2000年建立以来，更新了奥林巴斯显微镜，增添了超低温冰箱、低温高速离心机、荧光显微镜等设备。实验室的多媒体设备功能正在建设中。（负责人：梁新乐）

2．发酵工程实验室及生物工程实训中心：承担着《发酵工程实验》、《生物工程综合大实验》、《发酵过程控制与实验技术》等课程的教学任务。曾经获得“发酵工程与工业分析测试平台”、“生物工程产品创制实验室”等省级财政转项资金的支持，目前配备30-300升系列发酵罐、气相色谱仪、液相色谱仪、低温离心机、全温微生物振荡培养器等。 （负责人：陈敏）

3．分子生物学实验室：基因工程实验室承担着《分子生物学实验》、《基因工程实验》、《生物技术综合大实验》等课程的教学任务。配置有多种型号电泳仪、PCR仪、低温离心机、凝胶成象仪等。（负责人：宋达峰）

4．细胞工程实验室：细胞工程实验室承担着《细胞工程概论》、《细胞分子生物学》等课程的教学任务。目前配置有超净工作台、植物细胞培养室、多功能显微镜、植物细胞发酵培养系统等，动物细胞实验室处于筹建中。（负责人：赵艳）